酸洗處理樣本之目的，在于去除矽藻表面與內部之有機質，以方便觀察其表面紋路，酸洗方法有二，詳述如下：

 

 

 

方法一：取固定帶回之藻類樣本20 mL，加入適量過錳酸鉀晶體使成飽和溶液，靜置數天后加入適量鹽酸，加熱沸騰至溶液顏色呈透明淡黃色。以3000 rpm轉速離心沈淀矽藻，去除上層澄清液后以水清洗懸浮，重複三次后，即可得到白色之矽藻外殼沈淀物，裝瓶保存并記錄采樣時間、地點與采樣者姓名。

 

 

 

方法二：將藻類樣本約10 mL，以3000 rpm轉速離心10分鐘，除去上層澄清液后加入約5毫升之濃硫酸，加熱 至有機物被分解而轉變為黑褐色后，加入適量的硝酸鉀粉末，此時會有褐色氣體產生，繼續加熱至褐色氣體消失為止。待冷卻后離心除去上清液，加水懸浮、離心，重複三次將殘留的酸液清洗乾淨，后留下的純白色粉末即為矽藻的矽質外殼（賴雪端，1997）。裝瓶保存并記錄采樣時間、地點與采樣者姓名。

 

玻片制備

 

（1）新鮮水樣觀察：

 

取新鮮水樣一滴置于載玻片上，蓋上蓋玻片，以透明指甲油封片后一天內鏡檢觀察。

 

 

 

（2）酸洗后之矽藻外殼觀察

 

    取經酸洗置備好，含白色矽藻粉末樣本液適量，稀釋至適當濃度后，取一滴滴于蓋玻片上，加熱烘乾后，滴入適量的矽藻膠（pleurax）滴于蓋玻片上，稍稍加熱后蓋于載玻片上。接著在繼續加熱使矽藻膠充分滲入矽澡細胞壁，冷卻后即為矽藻細胞壁的永久玻片（賴雪端，1997）。矽藻膠為硫與酚的聚合物，折射率在1.4 ~ 1.5左右。

 

藻類分類與鑑定

 

在本研究中，藻類之分類依據是其外觀形態與表面紋路。在新鮮水樣中，常見之綠藻門如柵藻與盤星藻等，外型差異明顯，鑑定容易；但藍綠藻門與裸藻門等藻類，則需要完整的參考文獻與更細微的觀察，方能鑑定。金褐藻門中之矽藻，經過酸洗去除有機質后，矽質外殼表面之紋路將會顯現，其中縱溝、橫紋、極結節與中結節等之形態與分佈，都是重要之分類依據。